國家高新技術企業由科技部、財政部、稅務總局組成的全國高新技術企業認定管理工作領導小組認定。

其主要職責為:

(一)確定全國高新技術企業認定管理工作方向，審議高新技術企業認定管理工作報告;

(二)協調、解決認定及相關政策落實中的重大問題;

(三)裁決高新技術企業認定事項中的重大爭議，監督、檢查各地區認定工作;

(四)對高新技術企業認定工作出現重大問題的地區，提出整改意見。